biosafety.kz

Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности

Лаборатория Коллективного пользования

КОЖАБЕРГЕНОВ
НУРЛАН СИЯЗБЕКОВИЧ

заведующий лабораторией

Специалист в области молекулярной биологии, электронной микроскопии, NGS секвенирования и биоинформатики, разработки ПЦР тест-систем и биочипов. Автор более 60 научных трудов,  и 10 авторских свидетельств на изобретения и полезных моделей.

В 2021г. награжден медалью «Халық алғысы», в 2024 г. нагрудным знаком «Денсаулық сақтау ісінің үздігі». Проходил стажировки:  в 2007 году – в ВНИИЗЖ РФ, г. Владимир, по математическому моделированию эпизоотических процессов с применением ГИС; в 2012-2013 гг. в НИИ гриппа, г. Санкт-Петербург, по освоению современных средств диагностики на основе биологических микрочипов для идентификации и субтипирования вируса гриппа А; в сентябре 2013 года в Plum Island Animal Disease Center, штат New York, США, прошел международный курс обучения по трансграничным болезням животных; в 2016 году на базе Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН РФ, г. Москва, прошел курс обучения по работе с биологическими микрочипами; в 2018 году прошел стажировку в Los Alamos National Laboratory, штат New Mexico, США, по направлению «Секвенирование нового поколения и биоинформатика».

ORCID ID – https://orcid.org/0000-0001-6299-9399

Scopus ID – 56442641900

Web of Science ID- P-5334-2017

n.kozhabergen@biosafety.kz

+7(72636)7-22-28, вн. 137

Проекты:

AP09058338 Изучение противовирусной активности лекарственных препаратов в отношении вируса SARS-COV-2 in vitro и проведение молекулярно-эпидемиологического анализа циркулирующих штаммов COVID-19

Направление исследований лаборатории:

  • Экстракция и очистка нуклеиновых кислот из исследуемого биологического материала;
  • Идентификация микроорганизмов методами ПЦР и ОТ-ПЦР;
  • Количественное определение целевых мишеней методом цифровой ПЦР;
  • Разработка и синтез специфических олигонуклеотидов;
  • Фрагментное секвенирование ДНК, кДНК по методу Сэнгера;
  • Полногеномное и метагеномное (NGS) секвенирование микроорганизмов;
  • Генотипирование микроорганизмов;
  • Создание генетических паспортов;
  • Электронная микроскопия микроорганизмов;
  • Разработка диагностических препаратов;
  • Проведение обучающих семинаров, тренингов на рабочем месте.

Основные публикации лаборатории:  

  1. Bekbolat Usserbayev, Kunsulu Zakarya, Lespek Kutumbetov a, Mukhit Orynbaуev, Kulyaisan Sultankulova, Yergali Abduraimov, Balzhan Myrzakhmetova, Kuandyk Zhugunissov, Aslan Kerimbayev, Aibarys Melisbek, Meiіrzhan Shirinbekov, Saken Khaidarov, Asankadyr Zhunushov, Yerbol Burashev. Near-Complete Genome Sequence of a SARS-CoV-2 Variant B.1.1.7 Virus Strain Isolated in Kazakhstan. Microbiol Resour Announc. 2022 Aug 23;11(9):e00619-22. doi: 1128/mra.00619-22
  2. Yerbol Burashev, Bekbolat Usserbayev, Lespek Kutumbetov, Yergali Abduraimov, Markhabat Kassenov, Aslan Kerimbayev, Balzhan Myrzakhmetova, Aibarys Melisbek, Meirzhan Shirinbekov, Saken Khaidarov, Edan R Tulman. Coding Complete Genome Sequence of the SARS-CoV-2 Virus Strain, Variant B.1.1, Sampled from Kazakhstan. Microbiol Resour Announc. 2022 Nov 14;11(12):e01114-22. doi: 1128/mra.01114-22
  3. Yerbol Burashev, Mukhit Orynbayev Kunsulu Zakarya, Yergali Abduraimov, Markhabat Kassenov, Vitaliy Strochkov, Nurlan Kozhabergenov, Bekbolat Usserbayev, Aibarys Melisbek, Meirzhan Shirinbekov, Nuradyl Sypatay, Kulyaisan Sultankulova. Complete Coding Genome Sequence of an Influenza A/H3N8 Equine Virus Isolated in Kazakhstan in 2007. Genetics and Molecular Biology Announcement 12 September 2022
  4. S. Usserbayev, Ye.D. Burashev, N.S. Kozhabergenov, A.M. Melisbek, M.Zh. Shirinbekov, Ye.O. Abduraimov, K.D. Zakarya. Dynamics of the spread of SARS-COV-2 variants and clades. Вестник КазНУ. Экология сериясы. №2 (71). 2022. C.46-56 https://doi.org/10.26577/EJE.2022.v71.i2.05
  5. Yerbol Burashev, Bekbolat Usserbayev., Aibarys Melisbek, Meirzhan Shirinbekov, Saken Khaidarov. Covid-19 in Kazakhstan. Incidence statics andnew variations of the SARS-CoV-2 virus. 3 – rd International conference on Virology, infectious diseases and Covid-19. Dubai , UAE, october 24, 2022
  6. Bekbolat Usserbayev, Yergali Abduraimov, Nurlan Kozhabergenov, Aibarys Melisbek, Meirzhan Shirinbekov, Manar Smagul, Gaukhar Nusupbaуeva, Aziz Nakhanov, Yerbol Burashev. Complete Coding Sequence of a Lineage AY.122 SARS-CoV-2 Virus Strain Detected in Kazakhstan. Microbiol Resour Announc. 2023 Jun 13;12(7):e00301-23. doi: 10.1128/mra.00301-23
  7. Shirinbekov Meiirzhan Zhaksybekovich. Abdrakhmanova Burulkan Suparovna.  Usserbayev Bekbolat Sabituly. Melisbek Aibarys Markhabatuly. Saken Khaidarov. Burashev Yerbol Dosanovich. MODERN DIAGNOSTICS AND VACCINATION OF EQUINE INFLUENZA «Modern scientific technology» (February 9-10, 2023). Stockholm, Sweden, 2023
  8. Bekbolat Usserbayev, Yerbol Burashev, Nurlan Kozhabergenov, Assankadyr Zhunushov, Aibarys Melisbek, Meiіrzhan Shirinbekov, & Saken Khaidarov. (2023). Detection of the SARS-COV-2 virus variant B 1.1 in the Republic of Kazakhstan. Research Retrieval and Academic Letters, (1). Retrieved from https://ojs.scipub.de/index.php/RRAL/article/view/724
  9. Sultankulova, K.T.; Shynybekova, G.O.; Issabek, A.U.; Mukhami, N.N.; Melisbek, A.M.; Chervyakova, O.V.; Kozhabergenov, N.S.; Barmak, S.M.; Bopi, A.K.; Omarova, Z.D.; et al. The Prevalence of Pathogens among Ticks Collected from Livestock in Kazakhstan. Pathogens2022, 11, 1206. https://doi.org/10.3390/pathogens11101206
  10. Melisbek, A. M., Kendirbayeva, S. K., Userbaev, B. S., Shirinbekov, M. Z., Akbolat, G., Burashev, Y. D., Kozhabergenov, N. S., Bopi, A. K., Barakbaev, K. B., Nakhanov, A. K., Orynbayev, M. B. Sultankulova, K. T. GENETIC ANALYSIS OF NUCLEOPROTEIN OF A/H3N8 INFLUENZA VIRUS OF ASIAN AND EUROPEAN ORIGIN ISOLATED IN 2018. Eurasian Journal of Ecology, 2024, Vol 80, Issue 3, p102, ISSN 1563-034X, DOI: 10.26577/EJE.2024.v80.i3-010
  11. Khaidarov, S., Burashev , Y., Kozhabergenov , N., Usserbayev , B., Melisbek , A., Shirinbekov , M., Moldakaryzova, A., Beisenova , A., Mustafaeva , A., & Kydyrbaeva , A. (2024). Targeted in vitro- confirmation of the antiviral activity of Tenvir (Tenofovir) drug against the SARS-COV-2 virus variant B. in Kazakhstan and identifying NSP12 in the viral genome. Eurasian Journal of Applied Biotechnology, (2), 49–60. https://doi.org/10.11134/btp.2.2024.6